Bölge Müdürlüğümüz 29.06.2011 tarihinde 645 Sayılı Kanun Hükmünde Kararname ile Orman ve Su İşleri Bakanlığına bağlı olarak kurulmuştur. KHK ile Türkiye genelinde 15 adet Bölge Müdürlüğü kurulması kararlaştırılmıştır.
13.02.2018 tarihli ve 681 sayılı Bakanlık Makamı Oluru ile yürürlüğe 'Orman ve Su İşleri Bakanlığı Taşra Teşkilatının Kuruluşu ve Görevleri ile Çalışma Usül ve Esasları Hakkında Yönetmelik' gereğince, Merkez Burdur olmak üzere Antalya ve Isparta illerini kapsayan 6.Bölge Müdürlüğü kurulmuştur.
10.07.2018 tarihli ve 30474 sayılı Resmi Gazete'de yayımlanan 1 numaralı Cumhurbaşkanlığı Teşkilatı Hakkında Cumhurbaşkanlığı Kararnamesinin 410 nolu maddesinde Gıda Tarım ve Hayvancılık Bakanlığı ile Orman ve Su İşleri birleştirilerek Tarım ve Orman Bakanlığı kurulmuştur. Bölge Müdürlüğümüz bu bakanlığa bağlı olarak faaliyetine devam etmektedir.